RNA Ladder (0.125-6.0 kb)

RNAサイズマーカー

品名	Code No.	包装単位	価格	備考
RNA Ladder (0.125-6.0 kb)	311-06261	25 µl	12,000円
RNA Ladder (0.125-6.0 kb)	317-06263	25 µl x 2	16,000円

製造元 (株)ニッポンジーン

表示価格は希望納入価格 (税別) です。

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製品説明

本品は、in vitro 転写により調製された9 本のバンドからなるRNAサイズスタンダードラダーマーカーです。
本品は、変性アガロースでのRNA電気泳動にご使用いただけます。

RNA Ladder (0.125-6.0 kb)

フラグメント	塩基（base)
1	6,000
2	4,000
3	3,000
4	2,000
5	1,500
6	1,000
7	500
8	250
9	125

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製品内容

使用回数

1回あたり本品を1µl使用します。

RNA Ladder (25 µl)
構成品	容量	保存	備考
RNA Ladder	25μl x 1	-80°C	濃度：約1 µg/µl 形状： 10 mmol/l Tris-HCl(pH 8.0), 1 mmol/l EDTA(pH 8.0)

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使用例

使用方法

本品1 µl に、2.5 µl のTE（pH 8.0）と9 µl のRNA サンプル用バッファー^*1 を混合。
65℃で5 分間熱処理を行う。
熱処理後に急冷し、2.5 µl のRNA 用ローディングバッファー^*2 を混合。
ホルムアルデヒド変性アガロースゲルで電気泳動を行う。

*1 RNA サンプル用バッファー
Formamide	5 μl	10 x MOPS（pH 7.0）の組成： 200 mmol/l MOPS, 50 mmol/l NaOAc, 10 mmol/l EDTA, pH はNaOH で調整
10 x MOPS（pH 7.0）	1.5 μl
Formaldehyde	2 μl
1 mg/ml Ethidium Bromide	0.5 μl
Total	9 μl

*2 RNA 用ローディングバッファー
50％ Glycerol, 1 mmol/l EDTA(pH 8.0), 0.01％ Bromophenol blue

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Q & A

変性ポリアクリルアミドゲルで使用できますか？: 本品は、変性アガロースでの電気泳動にのみご使用いただけます。本品を変性ポリアクリルアミドゲルで使用した場合、バンドパターンが乱れることを確認しているため、変性ポリアクリルアミドゲルでは使用しないでください。

RNAの高次構造を壊すため熱処理を確実に実施したいです。: サーマルサイクラーを使用して、65℃で10分間→4℃で急冷する方法をお試しください。

8本のバンドしかありません。: 変性が不十分な場合、2000 baseのバンドと1500 base のバンドが重なってみえることがあります。以下のように調整した変性アガロースゲルと低ボルトでの泳動をお試しください。

ホルムアルデヒド変性アガロースゲル(1%)の調製および電気泳動

Agarose S…0.5 g
d.d.Water…31 mL
↓融解
↓粗熱を取る
約60℃になったところで5×MOPS Buffer…10 mL
ホルムアルデヒド液…9 mL ^*1
↓良く降り混ぜ、ゲルトレーに注ぐ
↓ゲルが固まった後、ゲルを泳動槽に移し、1×MOPS Bufferを注ぐ^*2
↓調製サンプル（15 μL）を全量アプライ ^*3
泳動（50Volts 30-60min）

*1 富士フイルム和光純薬（Code No. 064-00406）　
*2 コームは泳動槽にバッファーを満たした後で注意して抜いてください。（ウェルの底に亀裂がはいっていないか心配な場合は、泳動前にレーンに2 μLほどのRNAローディング液のみを注入して確認する方法をお試しください）　
*3 上記の使用方法のとおり調製したサンプルを使用

未変性のアガロースゲルで電気泳動を行いたい。: 変性剤を入れてサンプルを調製していただくと、以下のように泳動することができます。（変性剤が入っていない場合、バンドが重なったりします）

RNAサンプル調製
RNA Ladder	1 μl	RNA サンプル（3.5 μl）
TE（pH 8.0）	2.5 μl	RNA サンプル（3.5 μl）
Formamide	5 μl	RNA サンプル用バッファー（9 μl）
10 x MOPS（pH 7.0）	1.5 μl
Formaldehyde	2 μl
1 mg/ml Ethidium Bromide	0.5 μl